Un tercer alto el fuego fue llamado en marzo de 1994, pero, también, se rompió en mayo y agosto de 1995, después de que las fuerzas croatas recuperaron gran parte de la Krajina, lo que impulsa a un éxodo de los serbios de esta zona.
En noviembre de 1995, Croacia acordó reintegrar pacíficamente en Eslavonia Oriental, Baranja, y Srijem Occidental bajo los términos del acuerdo de Erdut, y el Gobierno croata volvió a establecer políticas y jurídicas autoridad sobre esos territorios en enero de 1998.
En diciembre de 1995, Croacia firmó el acuerdo de paz de Dayton, que se compromete a una cesación del fuego permanente y el regreso de todos los refugiados.
La muerte del Presidente Tudjman en diciembre de 1999, seguido por la elección de un gobierno de coalición y el Presidente a principios de 2000, trajo cambios significativos a Croacia.
El gobierno, bajo la dirección del entonces Primer Ministro Racan, avanzado en la aplicación de los Acuerdos de Paz de Dayton, la cooperación regional, el retorno de los refugiados, la reconciliación nacional y la democratización.
El 23 de noviembre de 2003, las elecciones nacionales se celebraron para el Parlamento, y el HDZ, que ha regido la independencia de Croacia hasta el año 2000, regresó al poder.
El HDZ gobierno, encabezado por el Primer Ministro Ivo Sanader, fue estrictamente re-elegido en una votación noviembre 2007, y el nuevo gobierno asumió el cargo el 12 de enero de 2008.
El Sanader prioridades del Gobierno sigue siendo la adhesión de Croacia en la Unión Europea y la OTAN. Las elecciones presidenciales se celebraron en enero de 2005.
Presidente Mesic, después de haber derrotado candidato de la HDZ en las elecciones que, se inauguró para un segundo mandato el 18 de febrero de 2005. Elecciones presidenciales el próximo se celebrará en enero de 2010.